El asiento contable sería 42/44 si es pago de mercadería y 10/44 si es retiro de efectivo con la tarjeta del dueño.

Enrtiendo que te refieres a su tarjeta de crédito personal. En este caso, se genera un pasivo para la empresa, una obligación por pagar al Titular. Contablemente sería los asientos 10/44 por el retiro de efectivo y 42/44 por el pago de la mercaderia con tarjeta personal. Tributariamente deberás elaborar contratos de mutuos dinerarios entre la empresa y el titular. La bancarización la tienes, puesto que todo se realizó con las tarjetas.

en caso de que el dueño de la EIRL decida hacer uso de su tarjeta de credito para la compra de productos y a la vez sacar efectivo de la tarjeta de credito para las compras de mercaderia para la empresa cual seria el tratamiento contable tributario

Y QUE PASARIA SI LA COMPRA LA PAGA CON TARJETA DE CREDITO NO SALE NI DE LA CUENTA DE LA EMPRESA NI EN EFECTIVO SINO LA TARJETA DE CREDITO DE LA PEROSNA QUE PAGA?

El cobro de la comisión debe ser asumido por la empresa y llevado al gasto. Si le transfiere ese costo al cliente, la empresa debe reconocerla como ingreso.

Siempre hay un desfase de 2 o tres dias, dependiendo la empresa. SIn embargo, si haces un corte, de hecho que te van a quedar saldo por cobrar y se debe a que el depósito lo realizan despues de 2 a 3 dias. No habria problema en tu circularización, ya que con los Estados de cuenta demuestras las fechas de depósitos.

Puedes trabajarlo con una cuenta por pagarle al accionista. Sin embargo, debes tener en cuenta que debes regularizar dicho pasivo con un contrato de mutuo.